En biologie, l’expérimentateur a souvent un jeu de mesures moyen à grand (100 à 100k lignes, plusieurs colonnes). C’est une matrice de mesures obtenus sur des individus pour un ensemble de paramètres cliniques ou biologiques. Les lignes de cette matrice sont les variables observées : gènes, protéines, pourcentages de types cellulaires… Les colonnes sont les individus. Les individus forment des groupes ayant des caractéristiques différentes : réponse à un médicament, rechute… L’expérimentateur cherche parmi les marqueurs (ie les variables/lignes) ceux qui sont associés au regroupement ou plus généralement à la réponse des individus.